miércoles, 16 de mayo de 2007

Más detalles del GOS


En el post anterior explicaba como el trabajo de Craig Venter y su equipo cambia nuestra percepcion de la microbiología con el GOS (Global Ocean Sampling). Venter navego los mares y tomo muestras de agua de mar a diferentes profundidades. En la imagen se pueden ver los puntos donde tomo estas muestras de 200 litros. Luego de procesar el agua de mar extrae el ADN de las mismas y lo secuencia. Por tanto, no es necesario cultivar los microorganismos para secuenciarlos. Esto es extraordinario. Anteriormente se necesitaba poder cultivar un microorganismo para caracterizarlo bioquímicamente, con este metodo nos saltamos un paso y podemos acercanos a la bioquímica de los microorganismos mas recalcitrantes. Por este procedimiento Venter logró aportar millones de secuencias nuevas que no han sido estudiadas a fondo.
¿Qué observó que es diferente de lo que conocemos?
Observó que la diversidad microbiana es rica en bacterias pertenecientes al grupo alfa-proteobacterias. En este grupo hay varias bacterias conocidas del suelo y algunos patógenos , sin embargo no lo hemos estudiado tan ampliamente como otros grupos de bacterias. La riqueza de la vida contenida en los mares, que ocupan el 70% de la superficie terrestre, puede esconder muchas soluciones a nuestros problemas además de ampliar nuestro conocimiento fuente última de la cultura.

martes, 15 de mayo de 2007

Craig Venter y las ideas locas

Hace unos años Criag Venter revolucionó la ciencia acortando significativamente los tiempos para secuenciar genomas. A partir de ahí el número de genomas conocidos o en proceso de conocerse fue explosivo, al día 8 de Mayo de 2007 hay 554 genomas secuenciados y publicados. Además de más de 1000 proyectos humano parece no detenerse ¿Cuánto durará? Nadie tiene una respuesta y más cuando en marcha. Esto queire decir que estamos frente a una revolución en la forma en que hacemos investigación, en como interpretamos los resultados y la forma en que hacemos nuevas preguntas. La ola que se abrió con la secuenciación del genomaCraig Venter vuelve a abrir otra puerta con la Global Ocean Sampling Expedition. Como resultado más de 6 millones de secuencias nuevas de microorganismos de los cuales no tenemos la más mínima noticia. De pronto descubrimos que existe un mundo nuevo ¿Cómo hacer para estudiarlo? La metodología actual tiene que cambiar tenemos que incorporar más potencia de computadoras, más gente capaz de procesar los datos y pensar las implicancias y, al final, juntar la información para plantear nuevas ideas, nuevas hipótesis que nos acerquen al mundo.
Si a alguien le interesa más acerca de esta expedición puede seguir este link Sorcerer II Expedition o ir al repositorio de las secuencias de ADN que se obtuvieron y se obtendran
Los trabajos que se publicaron a la fecha están en PLOS Biology.

Empezando...

Inicio este blog con el objetivo de volcar algunas de mis ideas respecto de la influcenia de la ciencia en todo lo que hacemos. Espero enriquecerlo con links a varios sitios interesantes (algunos de ellos en inglés) que son ilustrativos de lo que ocurre en la ciencia mundial.
Como vivo y trabajo en Argentina, mis opiniones son acerca de lo que ocurre en este país.